يعتبر المجلس العلمي جهازا استشاريا ، وتتمثل مهمته الأساسية في اقتراح سياسة البحث في الجامعة. تم تثبيت الصيغ الوظيفية للمجلس العلمي الخاص بالجامعة بموجب القرار الوزاري رقم 69 بتاريخ 6جوان 2004.